09 דצמבר 2010
וריאנט IB חדש (סימונו 703/10) זוהה במכון הווטרינרי, החטיבה למחלות עופות. ד"ר רוזי מאיר, מי שמרכזת את הפעילות בתחום הברונכיטיס המדבקת, זיהתה לאחרונה 4 בידודי שדה בעלי מאפיינים שונים מהמקובל. הבידודים התקבלו במעבדת המכון הווטרינרי ממקורות שונים: 3 מלהקות פטם, 1 מלהקת עופות חצר.
כל הדגימות נבדקו בשיטת ה- RT-PCR להגברת הגן השלם S1 ועברו סיווג ראשוני בשיטת ה- RFLP. כיוון שהתקבלו תבניות חיתוך חדשות בהן לא נתקלנו בעבר, הדגימות נשלחו לבדיקת רצף. לאחר עיבוד הנתונים ובדיקה כנגד המידע המופיע ב- GenBank התקבלו הממצאים הבאים: ב- 630 הנוקלאוטידים הראשונים מתחילת הגן נמצאה הומולוגיה של 99.8%, בין ארבעת הנגיפים לבין הווריאנט המוחלש 1494 (וריאנט 2, בידוד 2006) ו-74.7% הומוגיה לזן התרכיב 4/91. במקטע שבין 631-1600 הנוקלאוטידים הנותרים נמצאה הומולוגיה של 99.6-99.7% לזן התרכיב 4/91 והומולוגיה של 82% לוריאנט 2, בשניים מארבעת הנגיפים. בנגיף השלישי נמצאה רקומבינציה שנייה וחזרה לווריאנט 2 במקטע של 180 הנוקלאוטידים האחרונים בהומולוגיה מלאה. בדגימות מעופות החצר התקבלו תוצאות חלקיות המצביעות על מגמה דומה.ההערכה היא שהנגיף החדש התקבל כתוצאה מרקומבינציה בין וריאנט 2 לבין זן התרכיב 4/91.