30.08.2025
מאמר המתפרסם ב-Communications Biology עוסק בדינמיקת ההפצה של נגיף שפעת עופות אלים (HPAI) תת-סוג H5N8 בצרפת בשנים 2020–2021, תוך שימוש בכלים פילוגאוגרפיים ופילודינמיים לניתוח רצפים גנטיים מהתפרצויות רבות. המחקר מתמקד באזור דרום-מערב צרפת, המאופיין בצפיפות גבוהה במיוחד של משקי עופות, ובעיקר משקי ברווזים, אשר שימשו כמנוע מרכזי להתפשטות הנגיף.
נמצא כי נגיף שחדר בדצמבר 2020 לאזור עבר התפשטות נרחבת, עם מהירות ממוצעת של 10.5 ק"מ בשבוע ושיא של 27.8 ק"מ בשבוע. תקופת ההדבקה של חוות נאמדה בכ-9 ימים (חלון ההדבקה הסמוי, במהלכו משקים נגועים ממשיכים להפיץ נגיף לסביבה בטרם התגלתה המחלה. מקדם ההתפשטות האפקטיבי בין חוות (*Re) הגיע לשיא של 3.8, ערך גבוה משמעותית מהמדווח בגלים קודמים. צפיפות חוות הברווזים וקירבת משקים נמצאו כגורמים מרכזיים בקידום ההדבקה, בעוד שמרחקים גדולים בין משקים פעלו להפחתת הסיכון. המחקר גם מצביע על כך שרק שילוב של הסגרים וביצוע חקירה אפידמיולוגית עם פעולות נוספות כהשמדת עופות הצליחו לבלום את ההתפשטות.
ממצאי המחקר מספקים ביסוס מדעי למדיניות של הסגרים ברדיוס סביב מוקדי התפרצות. בכך המאמר מחזק את ההיגיון בהחלת צעדים מחמירים, לא רק כדי לבלום את התפשטות הנגיף אלא גם כדי למנוע זיהום סביבתי והעברה עקיפה באמצעות ציוד, תנועה של אנשים או בעלי-חיים.
Re הוא מדד אפידמיולוגי המתאר את מספר המקרים החדשים הנגרמים ולוקח בחשבון את השפעת גורמים כגון אמצעי בקרה, חיסון, בטיחות ביולוגית, צפיפות משקים, ותנאי סביבה. כאשר:
Re > 1 – כל משק נגוע מדביק בממוצע יותר ממשק אחד נוסף, והמחלה נוטה להתפשט.
Re = 1 – מספר המשקים הנדבקים נותר יציב, ללא עלייה או ירידה בהיקף ההתפשטות.
Re < 1 – כל משק נגוע מדביק פחות ממשק אחד נוסף בממוצע, וההתפרצות צפויה לדעוך בהדרגה.