05.05.2024

Virological.org

שני חלקי דו"ח על האפידמיולוגיה הגנומית של התפרצות נגיף שפעת עופות H5N1 בבקר בארה"ב פורסמו באתר virological.org על ידי יותר מ-20 חוקרים. המסקנות העיקריות:
אירוע reassortment בקרב נגיפי העופות H5N1 2.3.4.4b בצפון אמריקה התרחש זמן קצר לפני תחילת ההתפרצות בבקר. הרצפים של תבדידי הבקר שייכים כולם לגנוטיפ B3.13. גנוטיפ זה הוא שילוב בין הגנוטיפ האירו-אסיאתי H5N1 לבין הגנוטיפים הצפון אמריקאים בעלי פתוגניות נמוכה שנראו לראשונה בסוף שנת 2023. גנוטיפ זה נדיר יחסית בארה"ב אך נראה בציפורים כמו גם ביונקי בר. גנוטיפ B3.13 שונה מהנגיף שהיה מעורב בהתפרצות בעיזים.
להתפרצות שפעת העופות בבקר, היה ככל הנראה מקור יחיד מעופות שלאחריו התפשטות מבקר לבקר. ההתפרצות בעדרי החלב לא זוהתה ככל הנראה משך תקופה ארוכה (מספר חודשים). על פי הערכות החוקרים המעבר מעופות לבקר התרחש בין ה-13 בנובמבר ל-18 בינואר.
ההאמגלוטינין (HA) של נגיף ה-H5N1 מבקר, אינו תואם לקולטני אדם. ללא שינויים ב-HA המשפיעים על קישור הקולטן, הסיכון שהנגיף יעבור בין בני אדם נמוך.
נגיף הקשור קשר הדוק לאלו שנדגמו מבקר, אך נבדל מהם, נדגם מאדם שלפי הדיווחים היה עובד רפת. הרצף של התבדיד מהאדם (A/Texas/37/2024) אינו חולק את אותם שינויים מרובים הקיימים בכל רצפי הבקר, מה שמעלה השערה לגבי חוסר נתונים לגבי נגיפים נוספים שיתכן והיו מעורבים ולא נדגמו.

סכמה המתארת את היחסים הפילוגנטים בין מקטע HA ממינים שונים וזמן מוערך לחדירת הנגיף לעדרי הבקר (מקור: virological.com)